W dniu 25 czerwca 2007 r. zostało zawarte porozumienie pomiędzy Ministrem Środowiska a WFOŚiGW w Katowicach w sprawie realizacji Programu Operacyjnego „Infrastruktura i Środowisko”. Na podstawie tego porozumienia WFOŚiGW w Katowicach pełni rolę Instytucji Wdrażającej w zakresie realizacji Programu Operacyjnego „Infrastruktura i Środowisko” dla dwóch osi priorytetowych:
- Oś priorytetowa 1 - Gospodarka wodno-ściekowa
- Oś priorytetowa 2 - Gospodarka odpadami i ochrona powierzchni ziemi.